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PacBio(Sequel II/Sequel/RS II)

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単一分子ロングリードシーケンシングを持つ第三世代シーケンサー

Pacific Biosciencesは、単一分子リアルタイムシーケンシングの最も成功した商品化 これは、クラスターの増幅のためではなく、ビデオとして撮影され、シーケンスに変換される単一分子レベルでの蛍光の検出のためにポリメラーゼを使用し これは、現時点で市場にあるすべてのシーケンサーの中で最も長い読み取り長さ(平均20kb)を持ち、読み取り長が短い第二世代のシーケンサーよりも比類のない利点を提供しています。

DNA Linkは、PacBioシーケンサーを採用し、数年にわたって豊富な経験を持っている世界で最初の商業企業の一つです。

続編システム: SMRTシーケンシングへの高スループット、費用対効果の高いアクセス

新しいSequel IIシステムは、実績のある単一分子リアルタイム(SMRT)技術に基づ 続編システムは良質の全ゲノムde novoアセンブリおよび実物大のmicrobiomeの分析を急速にそして費用効果が大きい発生させることのようなプロジェクトに

両方の続編II&続編IはDNAリンクで利用可能です

RSII : 非常に最初のロングリードシーケンサー

PacBio RS IIは、科学界がより高品質のゲノム解析を追求し、遺伝的変異のフルサイズスペク この確立された技術によって、人間の生物医学的な研究、植物および動物のゲノミクスおよび微生物学のようないろいろな研究分野に2000の科学的な

PacBio RS IIは、小ゲノムの全ゲノム配列決定、標的配列決定、複雑な集団分析、標的転写物のRNA配列決定、および微生物エピジェネティクスに最適です。

PacBio RS IIは高性能光学、自動化された液体の処理、専有SMRTの細胞および試薬、および直観的な器械の制御ソフトウェアを特色にする。PacBio RS IIには、プライマリユーザーアクセスポイントが3つ含まれています。

:

  • RS Touch—タッチスクリーンインターフェイスを備えた計測器ソフトウェア(実行の開始と監視用)
  • 試薬とサンプルドロワー(プレートとサンプルロード用)
  • SMRTセルとチップドロワー(消耗品ロード用)

アプリケーション

PacBio®Single Molecule,Real-Time(SMRT)Sequencing technologyは、業界で利用可能な最長の平均読み取り長さのいくつかを一貫して生成します。 長い読み取りでは、高いコンセンサス精度(>99。999%、Q50)、均一なカバレッジ、および同時エピジェネティック検出–SMRTシーケンシングは、以前に科学界に利用できなかった貴重な洞察を提供します。

デノボアセンブリの全ゲノムシークエンシング

SMRTシークエンシングを使用したデノボアセンブリの全ゲノムシークエンシングは、すべての種にわたって連続した、非常に正確な参照ゲノムを生成するためのゴールドスタンダードです。 メガベースサイズのcontig N50S、コンセンサス精度>99%、およびハプロタイプを段階的にするためのツールでは、PacBioアセンブリは、検出されないSnp、完全に無傷の遺伝子、および断片化されたドラフトゲノムがしばしば見逃す複雑な構造に埋め込まれた調節領域を捕捉する。

構造変異体呼び出しの全ゲノムシークエンシング

SMRTシークエンシングは、個々の二倍体ヒトゲノムには、20,000以上のユニークな構造変異体(>50bpの長さ)と、400,000以上のindel変異体(1bpから49bpの長さ)が含まれていることを示している。 これらの変異体の80%以上は、現在、標準的な短読み取り配列決定法を使用して検出されていません。

RNA SEQUENCING

PacBio Isoform Sequence(Iso-Seq®)法は、5’末端からポリa尾部まで、各転写物アイソフォームの単一の、高精度な配列を送達するために長い読み取りを活用するこ

ターゲットシーケンス

PacBioターゲットシーケンスアプリケーションは、DNAオリゴハイブリダイゼーションを使用してアンプリコンシーケンスだけでなく、プローブベー 長い読み取りと低いシーケンスコンテキストバイアスを使用すると、関係なく、その遺伝的複雑さの関心の対象となる領域を特徴付けることができます—構造的変異、まれなSnp、インデル、コピー数の変化、マイクロサテライトと拡張保存された領域を含みます。

複雑な集団

細菌、ウイルス、および癌細胞は、多くの場合、多くのユニークで進化するゲノムを含む複雑な集団で発見されます。

複雑な集団

細菌、ウイルス、および癌細胞は、多くの場合、 これらの変異体は、環境条件、免疫圧力、または薬物治療に応答して急速な進化を可能にする。 共存する変異体を区別することは、複雑な組み立てを必要とする可能性があり、混合物内の密接に関連する個体の同定は非常に困難である。 SMRTシーケンシングは、不均一なサンプルの包括的な特性評価と複雑な変動の同定に必要な長い読み取り、単一分子分解能、および均一なカバレッジを提

エピジェネティクス

SMRTシーケンスは、シーケンス中のDNA塩基取り込みのポリメラーゼ動態の変化を測定することにより、DNA修飾を直接検出します。
高いスループット、長い読み取り、および増幅または
化学変換なしでエピジェネティックな修飾を検出する感度を使用すると、細菌および真核生物のゲノムインフォメーションを評価することができます。

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